No existen virus para hardware, puesto que los virus son software y unicamente atacan a software, eso no significa que no puedan llegar a dañar al hardware, por ejemplo haciendo que el reloj del procesador provoque un sobrecalentamienti y esto conlleve a que el procesador se queme.
En cuanto a tu problema lo que podria ser es que sea un virus de arranque, estos virus se eliminan con un formateo a bajo nivel, con programas como el Low Level Disk Format que es gratuito, asi que tendrias que formatear tu maquina y reinstalar todo los programas.
Podrias probar a correr un antivirus en modo a prueba de errores, para windows, ya que en este modo solo se inician los componentes principales de windows y muchas veces es eficas para eliminar algunos malwares que en un inicio normal no se pueden eliminar.
Para entrar a modo a pruebade fallos debes presionar la tecla F6 antes de que aparesca la pantalla de carga de windows y seleccionar dicha opcion.

Hola. Mi recomendación para tí es que limpies tu Sistema con cualquier Antivirus Rescue CD, el de AVG o Kapersky son muy eficaces. Yo por mi parte utilizo el Emsisoft Emergency USB Stick Suite. Este es un archivo que luego de descomprimirlo en una carpeta individual en tu PC requiere conexión con Internet para su actualización de definiciones. Una vez actualizado el software, te recomiendo desconectarte de la red y empezar el escaneo de tu Máquina. Luego de visualizar los resultados y emprender las acciones de limpieza de tu Sistema, podrías conectar, escanear y limpiar la unidad USB sin abrirla (Desactiva el Autorun inf.). Finalmente, y para evitar futuras infecciones, te recomiendo utilizar el Panda USB Vaccine para inmunizar tu Sistema y tu dispositivo USB. Con esto eliminarás el virus, gusano, bomba lógica o troyano, que probablemente ya tuvo acceso a un sector sensible del Sistema. Reevalúa tus opciones de seguridad: Podrías cambiar de Antivirus y añadir una solución de Firewall adicional. Con esto logrará una ampia seguridad y tranquilidad.

Te recomiendo norton internet security 2011 o 2012 o avast internet security.
Puedes descargarlos desde softonic o gratisprogramas.org
si no puedes con esos virus , lo que te queda por hacer es hacer un respaldo de todo.
Y formatear tu pc