Al reinstalar el sistema operativo ha de darte la opción de formatear sin guardar nada, o sea, dar formato completo, sólo lee atentamente todos los pasos. También puedes eliminar esa carpeta con los archivos viejos.

Al instalar cualquier sistema operativo tu disco duro se formatea no tienes que formataear 2 veces va!!

claro a medida que mas formatees peor es, al instalar windows 7 te aparece un cartel que tus datos se guardaran en una carpeta windows.old , pero que ya no se podran usar.
Y no existe manera de hacerlos funcionar.
Si quieres recuperar alguna foto , video , musica eso si se puede.
abre la carpeta windows.old y abre la carpeta de usuarios,selecciona el usuario que tengas y ahi eliges donde tenias tus cosas guardadas (esos datos no se pierden, exepto que los borres).
a pero ojo!! si tu windows anterior tenia virus, a lo mejor cuando copies algun archivo de la carpeta windows.old lo mas probable que pase con el archivo que estes transferiendo.
Saludos y suerte

eso quiere decir que lo has formateado con el programa de instalacion de windows, verdad?, lo único que tienes que hacer es formatear el disco desde alguna distro linux con GParted, si no dispones de ello prueba primero con el instalador de windows borrando la partición y creandola otra vez en vez de formatear la misma partición.